Para hacer lo que quieres te recomiendo que te empieces modificando algunos de los plugins para Rcmdr disponibles: RcmdrPlugin.TeachingDemos hecho por el propio John Fox o RcmdrPlugin.orloca hecho por mí mismo.
Para hacerlo debes descargar la versión fuente del paquete, descomprimir el fichero y luego hacer las modificaciones que quieras.
Una opción muy sencilla es la que propuso un asistente a las jornadas de R que se celebraron en Murcia y es usar el paquete miniGUI. Estoy puliendo un poco el ejemplo que me envió para subirlo.
Un saludo.
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Nuevo Menú en Rcmdr pero con opciones dinámicas
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